Preriscaldate il forno a 180°. Lavate bene il farro e fatelo cuocere seguendo le istruzioni riportate sulla confezione. Lavate le zucchine e scottatele in acqua bollente salata per circa 10 minuti.
Scolate il farro, passatelo sotto l’acqua fredda per fermare la cottura e trasferitelo in una ciotola. Unite al farro il pesto, la scamorza ridotta a cubetti e il prosciutto cotto.
Svuotate le zucchine e farcitele con il farro. Adagiatele poi su una teglia ricoperta di carta da forno, completate con un filo di olio e fate cuocere in forno caldo per circa 20 minuti. Sfornate e servite subito.